La GUI abbisogna di GTK 1.2.x o GTK 2.0 (non è completamente in GTK, ma i pannelli lo sono). Le skin sono salvate in formato PNG, così GTK, libpng (e le loro controparti di sviluppo, solitamente chiamate gtk-dev e libpng-dev) vanno installate. Puoi compilarla specificando --enable-gui quando esegui ./configure. Poi, per abilitare la GUI, devi lanciare il binario gmplayer.

Siccome MPlayer non ha una skin inclusa, devi scaricarne una se vuoi usare la GUI. Vedi la pagina di download. Queste devono essere decompresse nella directory di sistema ($PREFIX/share/mplayer/skins) o dell'utente $HOME/.mplayer/skins. MPlayer di default cerca in questi percorsi una directory chiamata default, ma puoi usare l'opzione -skin nomeskin, o la voce skin=nomeskin nel file di configurazione, per utilizzare la skin nella directory */skins/nomeskin.